Apie Covid-19 tyrimą iš seilių

Tyrimo kokybė. COVID-19 seilių PGR tyrimas

Testas sukurtas, validuotas ir atliekamas modernioje UAB „Diagnolita“ laboratorijoje laikantis aukščiausių kokybės standartų. Testui atlikti gauta valstybinės akreditacijos tarnybos licencija.

Nustatytas didesnis nei 99,98 % testo jautrumas ir 100 % specifiškumas. Testo veiksmingumas įrodytas atlikus biomedicininį tyrimą, bendradarbiaujant su LSMU Kauno klinikomis ir Kauno klinikine ligonine. Nustatytas 98,15 % sutapimas tarp teigiamų mėginių ir 98,11 % sutapimas tarp neigiamų mėginių lyginant seilių testą su klinikinėje praktikoje naudojamais nosiaryklės testais.

Testo kokybinė nustatymo riba (LOD – Limit of Detection) yra 400 kopijų / ml stabilizuoto seilių mėginio arba 800 kopijų / ml seilių. Pagal LOD vertę testas yra priskiriamas aukšto jautrumo testų klasei (Savela ES et al., 2021), kai LOD yra nuo 100 iki 1000 kopijų / ml. Testas atitinka V-2797 teisės akto reikalavimus, pagal kuriuos LOD turi būti ne daugiau nei 1000 viruso genomo ekvivalentų / ml ėminio.

Atliekant tyrimą, kiekviename mėginyje tiriami SARS CoV-2 viruso „spyglio“ (S) ir RNR polimerazės (RdRP) genai ir žmogaus endogeninė RNazės P RNR, kuri parodo ar tinkamai buvo surinktas, transportuotas ir išgrynintas mėginys.

UAB „Diagnolita“ darbuotojai seka informaciją apie Lietuvoje ir kitose šalyse plintančias SARS-CoV-2 viruso atmainas ir, atsiradus būtinybei, gali greitai koreguoti testą. Tokiu būdu yra užtikrinama, kad tyrimas išliks patikimas ir tikslus nepriklausomai nuo viruso mutacijų ir bus nustatomos visos Lietuvoje žinomos koronaviruso atmainos.

Kaip atliekamas Diagnolitos seilių COVID-19 PGR tyrimas?

Diagnolitoje sukurtas COVID-19 PGR tyrimas atliekamas naudojant paciento seilių mėginį. Seilių mėginio surinkimui pateikiamas mėgintuvėlis su specialiu piltuvėliu patogiam seilių surinkimui. Surinkus mėginį, užpilama seilių stabilizavimo terpė, kuri ištirpina viruso apvalkalėlį ir taip jį inaktyvuoja – stabdoma viruso galimybė plisti ir daugintis. Unikali terpės sudėtis taip pat stabilizuoja ir viruso RNR. Tai leidžia paruoštą mėginį laikyti kambario temperatūroje – nereikia specialaus temperatūros palaikymo transportuojant į laboratoriją. Į laboratoriją pristatytas mėginys užregistruojamas, atliekama nukleorūgščių išskyrimo procedūra, o PGR metodu nustatomas viruso buvimas mėginyje. Gautas tyrimo rezultatas pateikiamas elektroninėje sistemoje E.sveikata, pacientas apie rezultatus informuojamas elektroniniu paštu. Už papildomą mokestį gali būti išrašomas tyrimo rezultatus patvirtinantis sertifikatas.

Seilių PGR tyrimas yra toks pat tikslus kaip nosiaryklės mėginių PGR tyrimas

Diagnolitos, LSMU Kauno Klinikinės Ligoninės Infekcinių Ligų Klinikos bei Kauno Klinikų Laboratorinės Medicinos Klinikos specialistų atliktame tyrime, publikuotame moksliniame žurnale “Infection and Drug Resistance” pateikti rezultatai, palyginus seilių mėginių ir nosiaryklės mėginių tinkamumą nustatyti COVID-19 infekciją sukeliantį SARS-CoV-2 virusą. Gautieji rezultatai parodė, kad seilių mėginiuose virusas yra nustatomas taip pat patikimai, kaip ir iš nosiaryklės mėginių: teigiamų mėginių sutapimas 98,24 %, neigiamų mėginių sutapimas 98,11 %.

Kitų autorių atliktuose darbuose taip pat parodyta, kad seilių PGR testų jautrumas ir specifiškumas yra labai panašūs į nosiaryklės tepinėlių ir gauti skirtumai nėra statistiškai patikimi (Nasiri K, Dimitrova A, 2021; Butler-Laporte G et al., 2021). Remiantis šiais rezultatais, geriau rinktis PGR testą iš seilių, nes surenkant mėginį išvengiama artimo kontakto su medicinos personalu ir taip sumažinama viruso plitimo rizika (Nasiri K, Dimitrova A, 2021; Beyene GT et al., 2021). Kitas seilių PGR testo pranašumas yra tai, kad toks tyrimo būdas yra tinkamesnis vaikų ir karantine esančių asmenų testavimui (Butler-Laporte G et al., 2021).

Seilių PGR tyrimas leidžia nustatyti besimptominius ir ikisimptominius asmenis

Nature Medicine žurnale publikuotame tyrime buvo patvirtinta, kad SARS-CoV-2 virusas nustatomas besimptomių arba ikisimptomių užsikrėtusių žmonių burnos epitelio ir seilių liaukų ląstelėse. Nepaisant to, kad tiriamieji nejautė COVID-19 simptomų, nustatyta, kad jų seilėse esantis virusas buvo infektyvus (Huang N et al., 2021). Seilių tyrimo tinkamumą besimptomių žmonių testavimui patvirtina kitas, Singapūre atliktas, tyrimas, kurio rezultatai publikuoti Scientific Reports žurnale. Tyrimo metu buvo lyginami seilių, nosiaryklės ir nosies landos tepinėlių mėginiai. Tiriant besimptomius ir silpnus simptomus jaučiančius COVID-19 užsikrėtusius žmones buvo gauta, kad seilių PGR tyrimo jautrumas yra panašus arba geresnis negu nosiaryklės ir nosies landos tyrimų (Teo AKJ et al., 2021).

Seilių PGR tyrimas pranašesnis vaikų testavimui

Tėvai dažnai nesutinka, kad jų vaikai būtų tiriami paimant nosiaryklės tepinėlio mėginį, nes mėginio paėmimo procedūra yra invazinė ir nemaloni. Todėl Šveicarijoje, Ciuricho mieste, kaip alternatyva vaikų testavimui buvo svarstyta naudoti seilių mėginius, kurių surinkimas yra paprastesnis ir neinvazinis. Ištyrus 170 vaikų buvo gauta, kad seilių PGR tyrimo rezultatai gerai sutapo su nosiaryklės PGR tyrimo rezultatais: teigiamų mėginių sutapimas buvo 93.3% (78.0–99.2%) ir neigiamų mėginių sutapimas buvo 96.4% (91.9–98.8%). Atsižvelgiant į šiuos rezultatus, Ciuricho miesto mokyklose nuspręsta pradėti masinį PGR testavimą nustatant SARS-CoV-2 RNR iš seilių mėginių (Huber M et al., 2021).

Nuorodos:

1. Butler-Laporte G et al. Comparison of Saliva and Nasopharyngeal Swab Nucleic Acid Amplification Testing for Detection of SARS-CoV-2: A Systematic Review and Meta-analysis. JAMA Intern Med. 2021 Mar 1;181(3):353-360. doi: 10.1001/jamainternmed.2020.8876. Erratum in: doi: 10.1001/jamainternmed.2021.0245. PMID: 33449069; PMCID: PMC7811189.
2. Huang N et al. SARS-CoV-2 infection of the oral cavity and saliva. Nature medicine 2021. Nat Med. 2021 Mar 25.;doi: 10.1038/s41591-021-01296-8.
3. Huber M et al. High Efficacy of Saliva in Detecting SARS-CoV-2 by RT-PCR in Adults and Children. Microorganisms 2021, 9(3), 642. https://doi.org/10.3390/microorganisms9030642.
4. Teo AKJ et al. Saliva is more sensitive than nasopharyngeal or nasal swabs for diagnosis of asymptomatic and mild COVID-19 infection. Sci Rep. 2021 Feb 4;11(1):3134. doi: 10.1038/s41598-021-82787-z. PMID: 33542443; PMCID: PMC7862309.
5. Nasiri K, Dimitrova A. Comparing saliva and nasopharyngeal swab specimens in the detection of COVID-19: A systematic review and meta-analysis. J Dent Sci. 2021 Jan 29. doi: 10.1016/j.jds.2021.01.010. Epub ahead of print. PMID: 33558826; PMCID: PMC7846225.
6. Beyene GT et al. Saliva is superior over nasopharyngeal swab for detecting SARS-CoV2 in COVID-19 patients. Sci Rep. 2021; 11: 22640. doi: 10.1038/s41598-021-02097-2. PMID: 34811429; PMCID: PMC8608806.